Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcr5Q04683 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cxcr5Q04683 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms