Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smpd1Q04519 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smpd1Q04519 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd1Q04519 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd1Q04519 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms