Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CkbQ04447 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CkbQ04447 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CkbQ04447 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CkbQ04447 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CkbQ04447 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CkbQ04447 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CkbQ04447 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CkbQ04447 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CkbQ04447 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CkbQ04447 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CkbQ04447 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CkbQ04447 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CkbQ04447 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CkbQ04447 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CkbQ04447 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CkbQ04447 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CkbQ04447 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CkbQ04447 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CkbQ04447 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CkbQ04447 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms