Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Thbs2Q03350 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Thbs2Q03350 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms