Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hivep1Q03172 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hivep1Q03172 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hivep1Q03172 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms