Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb5Q02739 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjb5Q02739 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjb5Q02739 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms