Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GscQ02591 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GscQ02591 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GscQ02591 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GscQ02591 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GscQ02591 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GscQ02591 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GscQ02591 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GscQ02591 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GscQ02591 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GscQ02591 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GscQ02591 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GscQ02591 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GscQ02591 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GscQ02591 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GscQ02591 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GscQ02591 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GscQ02591 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GscQ02591 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GscQ02591 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GscQ02591 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GscQ02591 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GscQ02591 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GscQ02591 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GscQ02591 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GscQ02591 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GscQ02591 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GscQ02591 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GscQ02591 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GscQ02591 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GscQ02591 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GscQ02591 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GscQ02591 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GscQ02591 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GscQ02591 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GscQ02591 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GscQ02591 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GscQ02591 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GscQ02591 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GscQ02591 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GscQ02591 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GscQ02591 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GscQ02591 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GscQ02591 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GscQ02591 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GscQ02591 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GscQ02591 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GscQ02591 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GscQ02591 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GscQ02591 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GscQ02591 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GscQ02591 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GscQ02591 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GscQ02591 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GscQ02591 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GscQ02591 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GscQ02591 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GscQ02591 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GscQ02591 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GscQ02591 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GscQ02591 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GscQ02591 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GscQ02591 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GscQ02591 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GscQ02591 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GscQ02591 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GscQ02591 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GscQ02591 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GscQ02591 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GscQ02591 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GscQ02591 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GscQ02591 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GscQ02591 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GscQ02591 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GscQ02591 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GscQ02591 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GscQ02591 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GscQ02591 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GscQ02591 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GscQ02591 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GscQ02591 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GscQ02591 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GscQ02591 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GscQ02591 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GscQ02591 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GscQ02591 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GscQ02591 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GscQ02591 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GscQ02591 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GscQ02591 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms