Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VcpQ01853 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VcpQ01853 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VcpQ01853 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VcpQ01853 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VcpQ01853 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VcpQ01853 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms