Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme2Q01768 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme2Q01768 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme2Q01768 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms