Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Top2aQ01320 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2aQ01320 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2aQ01320 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Top2aQ01320 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Top2aQ01320 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms