Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EgfrQ01279 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EgfrQ01279 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EgfrQ01279 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EgfrQ01279 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms