Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col1a2Q01149 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col1a2Q01149 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col1a2Q01149 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col1a2Q01149 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms