Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csf2raQ00941 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csf2raQ00941 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csf2raQ00941 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csf2raQ00941 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csf2raQ00941 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csf2raQ00941 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Csf2raQ00941 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf2raQ00941 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Csf2raQ00941 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2raQ00941 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms