Protein–RNA interactions for Protein: P99025

Gchfr, GTP cyclohydrolase 1 feedback regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GchfrP99025 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GchfrP99025 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GchfrP99025 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GchfrP99025 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GchfrP99025 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GchfrP99025 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GchfrP99025 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GchfrP99025 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms