Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
AlkP97793 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
AlkP97793 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
AlkP97793 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
AlkP97793 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
AlkP97793 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
AlkP97793 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AlkP97793 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AlkP97793 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AlkP97793 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AlkP97793 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
AlkP97793 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
AlkP97793 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AlkP97793 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AlkP97793 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AlkP97793 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
AlkP97793 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AlkP97793 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
AlkP97793 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
AlkP97793 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
AlkP97793 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
AlkP97793 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
AlkP97793 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
AlkP97793 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
AlkP97793 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
AlkP97793 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
AlkP97793 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
AlkP97793 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
AlkP97793 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
AlkP97793 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AlkP97793 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AlkP97793 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AlkP97793 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AlkP97793 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AlkP97793 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AlkP97793 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
AlkP97793 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
AlkP97793 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AlkP97793 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AlkP97793 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AlkP97793 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
AlkP97793 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AlkP97793 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AlkP97793 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AlkP97793 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AlkP97793 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
AlkP97793 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
AlkP97793 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
AlkP97793 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
AlkP97793 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
AlkP97793 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
AlkP97793 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
AlkP97793 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
AlkP97793 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
AlkP97793 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
AlkP97793 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
AlkP97793 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
AlkP97793 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
AlkP97793 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
AlkP97793 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
AlkP97793 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
AlkP97793 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
AlkP97793 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
AlkP97793 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
AlkP97793 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
AlkP97793 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
AlkP97793 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
AlkP97793 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
AlkP97793 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
AlkP97793 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
AlkP97793 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
AlkP97793 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
AlkP97793 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
AlkP97793 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
AlkP97793 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
AlkP97793 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
AlkP97793 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
AlkP97793 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
AlkP97793 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
AlkP97793 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
AlkP97793 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
AlkP97793 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
AlkP97793 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
AlkP97793 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
AlkP97793 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
AlkP97793 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
AlkP97793 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
AlkP97793 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
AlkP97793 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AlkP97793 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
AlkP97793 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AlkP97793 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AlkP97793 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AlkP97793 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
AlkP97793 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
AlkP97793 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AlkP97793 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AlkP97793 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
AlkP97793 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
AlkP97793 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms