Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nbr1P97432 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nbr1P97432 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nbr1P97432 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms