Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis3P97368 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis3P97368 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis3P97368 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis3P97368 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis3P97368 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis3P97368 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis3P97368 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms