Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf1bP97358 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf1bP97358 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf1bP97358 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms