Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx2-3P97334 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx2-3P97334 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx2-3P97334 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nkx2-3P97334 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx2-3P97334 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms