Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrp1P97333 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrp1P97333 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrp1P97333 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms