Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx2P80206 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx2P80206 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx2P80206 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otx2P80206 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx2P80206 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx2P80206 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otx2P80206 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otx2P80206 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms