Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8a1P70704 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp8a1P70704 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp8a1P70704 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms