Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tp53bp1P70399 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tp53bp1P70399 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms