Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ufd1P70362 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufd1P70362 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufd1P70362 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms