Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp7P70280 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vamp7P70280 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms