Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema3eP70275 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sema3eP70275 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sema3eP70275 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3eP70275 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms