Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtgdrP70263 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtgdrP70263 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms