Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd13P70217 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxd13P70217 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd13P70217 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms