Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plxna3P70208 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plxna3P70208 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plxna3P70208 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plxna3P70208 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plxna3P70208 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Plxna3P70208 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms