Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf6P70196 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf6P70196 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf6P70196 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf6P70196 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf6P70196 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Traf6P70196 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf6P70196 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf6P70196 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf6P70196 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf6P70196 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf6P70196 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf6P70196 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms