Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acta1P68134 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acta1P68134 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Acta1P68134 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acta1P68134 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta1P68134 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acta1P68134 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acta1P68134 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta1P68134 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms