Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps17P63276 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps17P63276 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps17P63276 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps17P63276 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps17P63276 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps17P63276 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps17P63276 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps17P63276 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps17P63276 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps17P63276 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps17P63276 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms