Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg2P63268 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg2P63268 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Actg2P63268 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actg2P63268 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg2P63268 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg2P63268 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg2P63268 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actg2P63268 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg2P63268 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms