Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg1P63260 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actg1P63260 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actg1P63260 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg1P63260 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actg1P63260 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms