Protein–RNA interactions for Protein: P63038

Hspd1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspd1P63038 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hspd1P63038 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hspd1P63038 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hspd1P63038 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hspd1P63038 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hspd1P63038 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms