Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbpl1P62340 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbpl1P62340 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms