Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrch1P62046 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrch1P62046 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms