Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo4P61969 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo4P61969 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms