Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Vbp1P61759 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vbp1P61759 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms