Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abce1P61222 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abce1P61222 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Abce1P61222 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abce1P61222 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abce1P61222 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abce1P61222 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abce1P61222 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abce1P61222 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms