Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdrg1P59048 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdrg1P59048 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdrg1P59048 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms