Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps33bP59016 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vps33bP59016 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Vps33bP59016 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33bP59016 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms