Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm2P58774 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm2P58774 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms