Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P58686 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P58686 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P58686 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P58686 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P58686 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P58686 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P58686 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P58686 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P58686 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P58686 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
P58686 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P58686 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P58686 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P58686 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P58686 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P58686 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P58686 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P58686 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P58686 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P58686 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P58686 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P58686 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P58686 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P58686 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P58686 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
P58686 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P58686 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P58686 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P58686 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P58686 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
P58686 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P58686 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P58686 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P58686 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P58686 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P58686 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P58686 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P58686 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P58686 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P58686 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P58686 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
P58686 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P58686 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
P58686 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
P58686 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P58686 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P58686 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P58686 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P58686 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P58686 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P58686 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P58686 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P58686 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P58686 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P58686 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P58686 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P58686 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P58686 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P58686 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P58686 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P58686 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P58686 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P58686 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P58686 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P58686 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
P58686 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms