Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Paxbp1P58501 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paxbp1P58501 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Paxbp1P58501 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms