Protein–RNA interactions for Protein: P58462

Foxp1, Forkhead box protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp1P58462 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Foxp1P58462 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxp1P58462 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxp1P58462 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxp1P58462 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxp1P58462 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxp1P58462 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxp1P58462 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxp1P58462 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms