Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Strn4P58404 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Strn4P58404 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Strn4P58404 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Strn4P58404 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Strn4P58404 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Strn4P58404 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Strn4P58404 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Strn4P58404 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms