Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpaP58389 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpaP58389 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpaP58389 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpaP58389 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpaP58389 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpaP58389 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpaP58389 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpaP58389 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpaP58389 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms