Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FusP56959 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FusP56959 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FusP56959 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FusP56959 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FusP56959 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FusP56959 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FusP56959 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FusP56959 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FusP56959 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FusP56959 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FusP56959 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FusP56959 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FusP56959 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FusP56959 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FusP56959 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FusP56959 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FusP56959 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FusP56959 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FusP56959 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FusP56959 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FusP56959 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FusP56959 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FusP56959 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FusP56959 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FusP56959 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FusP56959 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FusP56959 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FusP56959 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FusP56959 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FusP56959 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FusP56959 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FusP56959 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FusP56959 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FusP56959 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FusP56959 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FusP56959 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FusP56959 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FusP56959 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FusP56959 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FusP56959 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FusP56959 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FusP56959 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FusP56959 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FusP56959 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FusP56959 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FusP56959 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FusP56959 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FusP56959 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FusP56959 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FusP56959 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FusP56959 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FusP56959 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FusP56959 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FusP56959 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FusP56959 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FusP56959 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FusP56959 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FusP56959 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FusP56959 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FusP56959 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FusP56959 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FusP56959 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FusP56959 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FusP56959 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FusP56959 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FusP56959 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FusP56959 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FusP56959 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FusP56959 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FusP56959 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FusP56959 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms