Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GemP55041 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GemP55041 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GemP55041 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GemP55041 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GemP55041 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GemP55041 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GemP55041 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GemP55041 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GemP55041 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GemP55041 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GemP55041 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GemP55041 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GemP55041 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GemP55041 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GemP55041 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GemP55041 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GemP55041 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GemP55041 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GemP55041 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GemP55041 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GemP55041 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GemP55041 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GemP55041 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GemP55041 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GemP55041 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GemP55041 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GemP55041 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GemP55041 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GemP55041 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GemP55041 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GemP55041 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GemP55041 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GemP55041 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GemP55041 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GemP55041 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GemP55041 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GemP55041 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GemP55041 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GemP55041 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GemP55041 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GemP55041 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GemP55041 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GemP55041 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GemP55041 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GemP55041 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GemP55041 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GemP55041 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GemP55041 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GemP55041 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GemP55041 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GemP55041 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GemP55041 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GemP55041 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GemP55041 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GemP55041 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GemP55041 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GemP55041 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GemP55041 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GemP55041 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GemP55041 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GemP55041 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GemP55041 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GemP55041 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GemP55041 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GemP55041 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GemP55041 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GemP55041 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GemP55041 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GemP55041 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GemP55041 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GemP55041 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GemP55041 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GemP55041 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GemP55041 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GemP55041 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GemP55041 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GemP55041 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GemP55041 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GemP55041 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GemP55041 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GemP55041 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GemP55041 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GemP55041 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GemP55041 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GemP55041 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GemP55041 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GemP55041 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GemP55041 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GemP55041 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms